Alex J. Mercer (Tunnetaan myös nimeltä Prototype ja koodinimeltä Zeus) on Blacklighttin entinen johtaja Gentek projektissa. Alex pystyy muuttumaan toisen ihmisen näköiseksi.
Triviaa
Kun Alex kuuli, että kaikki projektissa olleet tapettaisiin, Alex pakeni kaupunkiin ja päästi Blacklight-viiruksen valloilleen. Viirus levisi koko Manhattiin ja joistain ihmisistä tuli "zombeja".
Alex J. Mercer
Alexin biomassa käsiä.
Sukupuoli: mies
Aseet: Voi muokata rumiistaan tappavia aseita, Armeijan tuliaseet. Panssarivaunut ja helikopterit